2009年10月13日，马岙港区公共航道整治工程顺利通过了交工验收，省港航局、浙江海事局、省厅质监局、舟山海事局、市交通委、舟山引航站以及设计、监理、施工等单位参加了本次会议，这标志着马岙港区公共航道整治工程已建设完成，将投入使用。

马岙港区公共航道整治工程分灌门进港航道和龟山航门航道，建设规模为灌门航道满足10万吨级船舶双向通航，其中狭口段宽度满足10万吨级及5万吨级双向通航要求，灌门狭口以外段炸礁深度满足15万吨级船舶通航尺度要求；龟山航口门航道满足5万吨级船舶双向通航要求。整体工程包括炸礁192238m³；新建香炉花瓶礁、秀山东（钓浪北）、秀山西三处大型锚地，面积共43.3km²；设置灯浮标5座、灯桩3座、雷达应答器2座，撤除灯浮标2座，安装灯标遥测遥控系统26套；新建水文波浪站一座。

整个工程自2007年11月正式开工，参建各方努力克服工程区域水流湍急（最大流速达465cm/s，折合为8.6节）、水文异常复杂的工况，历经21个月，顺利的完成了工程的建设，并提交了安全“零事故”的完美答卷。

马岙港区公共航道的开发建设，进一步完善了舟山港口基础设施，提升了港口服务能力，它将为马岙港区、岱山高亭港区服务，并为长白、秀山、岱山修船基地的建设与我国修造船业“东移”整体布局创造了条件，对加快该区域临海工业园区建设以及原材料集疏运创造良好的水运条件。